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                                      LeDock LeDock(分子对接软件) V1.0 绿色版 版本

                                        LeDock 是一款灵活实用的小分子对接软件,为了快速准确地将小分子对接成蛋白质而设计的。在Astex多样性集上,它实现了大于90%的位姿预测精度,并且对于药物样分子,每次运行大约需要3秒钟。它导致从高通量虚拟筛选运动中发现新的激酶抑制剂和溴代氨酶?#21331;?#21058;。它直接使用SybYLMOL2格式作为小分子的输入。Windows操作系?#25104;?#30340;图形版本极大地简化了药物化学家的常见多重复杂的对接过程。

                                      LeDock

                                      【功能特点】

                                        位姿预测的高精度

                                        用户友好的虚拟筛选和点击?#23500;?/p>

                                        非常快

                                      LeDock

                                      【使用说明】

                                        1. 抽取受体。

                                        直接运行 LeDock.exe

                                        结果可以发现,Lepro可以自动去除杂原子,并加氢,残基的名字也改为charmm的命名方式。Arg226在晶体结构中构象不确定,Lepro自动保存第一个;

                                        2. 对接的盒子

                                        Lepro还产生一个dock.in的对接配置文件:

                                        输入文件包含以下信息:

                                        //

                                        Receptor

                                        pro.pdb

                                        RMSD

                                        1.0

                                        Binding pocket

                                        xmin xmax

                                        ymin ymax

                                        zmin zmax

                                        Number of binding poses

                                        20

                                        Ligands list

                                        ligands.list

                                        //

                                        “Receptor”、“Binding pocket”、“Number of binding poses”和“Ligands list”是关键词,不可更改。

                                      软件特别说明

                                      标签: LeDock 分子模型

                                      其他版本下载
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