當下軟件園 / 匯聚當下最新最酷的軟件下載站!
                                      當下軟件園
                                      您的位置: 首頁 > 應用軟件 > 行業軟件 > LeDock(分子對接軟件) V1.0 綠色版
                                      LeDock LeDock(分子對接軟件) V1.0 綠色版 版本

                                        LeDock 是一款靈活實用的小分子對接軟件,為了快速準確地將小分子對接成蛋白質而設計的。在Astex多樣性集上,它實現了大于90%的位姿預測精度,并且對于藥物樣分子,每次運行大約需要3秒鐘。它導致從高通量虛擬篩選運動中發現新的激酶抑制劑和溴代氨酶拮抗劑。它直接使用SybYLMOL2格式作為小分子的輸入。Windows操作系統上的圖形版本極大地簡化了藥物化學家的常見多重復雜的對接過程。

                                      LeDock

                                      【功能特點】

                                        位姿預測的高精度

                                        用戶友好的虛擬篩選和點擊細化

                                        非常快

                                      LeDock

                                      【使用說明】

                                        1. 抽取受體。

                                        直接運行 LeDock.exe

                                        結果可以發現,Lepro可以自動去除雜原子,并加氫,殘基的名字也改為charmm的命名方式。Arg226在晶體結構中構象不確定,Lepro自動保存第一個;

                                        2. 對接的盒子

                                        Lepro還產生一個dock.in的對接配置文件:

                                        輸入文件包含以下信息:

                                        //

                                        Receptor

                                        pro.pdb

                                        RMSD

                                        1.0

                                        Binding pocket

                                        xmin xmax

                                        ymin ymax

                                        zmin zmax

                                        Number of binding poses

                                        20

                                        Ligands list

                                        ligands.list

                                        //

                                        “Receptor”、“Binding pocket”、“Number of binding poses”和“Ligands list”是關鍵詞,不可更改。

                                      軟件特別說明

                                      標簽: LeDock 分子模型

                                      其他版本下載
                                      相關文章
                                      最新評論
                                      回頂部 去下載

                                      關于本站|下載幫助|下載聲明|軟件發布|聯系我們

                                      Copyright ? 2005-2018 www.rfik.tw.All rights reserved.

                                      浙ICP備06019006號

                                      辽宁11选5历史记录